Po zarejestrowaniu jednostki w systemie RJPS wraz z wnioskiem o zarejestrowanie jednostki, zostaje zarejestrowany pierwszy użytkownik tej jednostki. Aby zarejestrować kolejnych użytkowników, należy zarejestrować wniosek o nowego użytkownika.
Aby rozpocząć rejestrację użytkownika, z jednostki zarejestrowanej już w systemie RJPS, na głównej stronie Rejestru Polityki Społecznej http://rjps.mpips.gov.pl wybieramy link Zarejestruj.
Otworzy się okno "Formularz rejestracji użytkownika", w którym należy uzupełnić wszystkie obowiązkowe pola.
Imię - imię użytkownika, który będzie aktualizował dane jednostki w systemie RJPS;
Nazwisko - nazwisko użytkownika, który będzie aktualizował dane jednostki w systemie RJPS;
Telefon - numer telefonu do użytkownika, który będzie aktualizował dane jednostki w systemie RJPS;
E-mail - adres mailowy użytkownika, który będzie aktualizował dane jednostki w systemie RJPS (E-mail powtarzamy w polu Powtórzenie e-mail);
Uwaga! Na wskazany e-mail zostanie wysłana informacja o rejestracji wniosku, wraz z wydrukiem, a także informacja po rozpatrzeniu wniosku przez administratora.
Login - definiujemy nazwę jaką chcemy posługiwać się w systemie - ponieważ login musi być unikalny w ramach wszystkich użytkowników RJPS, tak więc może się okazać, że otrzymamy komunikat informujący, że taki login jest już wykorzystany i trzeba będzie wpisać inną nazwę;
Uwaga! Login może zawierać litery, cyfry, znaki "-" i "_", nie może zawierać polskich znaków.
Hasło - definiujemy hasło jakim chcemy posługiwać się podczas przesyłania sprawozdań (hasło to powtarzamy w polu Powtórzenie hasła);
Uwaga! Hasło musi spełniać następujące kryteria:
| - | musi zawierać co najmniej 8 znaków. |
| - | musi zawierać co najmniej jedną cyfrę lub znak specjalny z puli "!@#$%^&*()-_=+". |
| - | nie może zawierać znaków regionalnych i symboli. |
| - | może zawierać maksymalnie 19 znaków. |
Jeżeli jedno z tych kryteriów nie będzie spełnione, pojawi się odpowiedni komunikat, informujący o tym fakcie.
W sekcji Jednostki mamy możliwość przypisania użytkownikowi jednej lub kilku jednostek. W tym celu należy wybrać przycisk 
. Otworzy się okno "Wybór jednostki", w którym wskazujemy jednostkę, którą chcemy przypisać użytkownikowi, a następnie akceptujemy wybór za pomocą przycisku
. Dane wskazanej jednostki lub jednostek pojawią się w kolumnach Nazwa jednostki, Adres, Typ jednostki. Danych tych nie możemy modyfikować.
Aby usunąć jednostkę z listy przypisanych użytkownikowi jednostek należy zaznaczyć na liście taką jednostkę, następnie wybrać przycisk 
.
Po uzupełnieniu/sprawdzeniu wszystkich danych dotyczących użytkownika wybieramy przycisk .
Otworzy się okno przeglądarki internetowej z podglądem wniosku rejestracji użytkownika w systemie RJPS.
Jednocześnie w aplikacji RJPS otworzy się okno "Potwierdzenie przesłania wniosku rejestracyjnego", informujące, że dane rejestracji zostały przesłane do administratora.
Po otrzymaniu informacji od administratora o akceptacji wniosku rejestracyjnego możemy zalogować się do aplikacji RJPS.
Uwaga! Administrator wojewódzki rozpatruje wnioski, które dotyczą tylko jednostek zlokalizowanych w jego województwie (organizacji). Oznacza to, że wniosek złożony o użytkownika jednostek z dwóch różnych województw, rozpatrywany będzie przez dwóch różnych administratorów wojewódzkich. Pozytywne rozpatrzenie wniosku przez jednego z administratorów, spowoduje, że użytkownik będzie miał uprawnienia tylko w ramach jednostek z tego województwa. Dostęp do jednostek w ramach kolejnego województwa uzyska po pozytywnym rozpatrzeniu wniosku przez administratora wojewódzkiego "właściwego" dla tej jednostki. Administrator centralny rozpatruje wszystkie wnioski w całości.