W górnej części okna "Lista jednostek" znajdują się pola, które dają możliwość filtrowania wyświetlanych jednostek na mapie i na liście pod mapą, zgodnie z następującymi kryteriami:
| - | nazwa/adres/dane jednostki - w polu Wpisz nazwę/adres/dane jednostki możemy wpisać frazę, dotyczącą danej jednostki np. część nazwy, adres, inne dane. Aby wyszukać jednostki wg wprowadzonej frazy, wybieramy ikonę Szukaj  . Wyświetlone zostaną tylko te jednostki, które w "Słowach kluczowych" zawierają wyszukiwaną frazę. |
| - | typy jednostki - z listy rozwijanej mamy możliwość wyboru jednego lub kilku typów jednostek dostępnych w systemie. |
| - | województwa - z listy rozwijanej mamy możliwość wyboru jednego lub kilku województw. |
| - | powiaty - w przypadku wybrania jednego lub kilku województw, w filtrze powiatów mamy możliwość wyboru jednego lub kilku powiatów należących do wskazanych wcześniej województw. Filtr powiatów nie będzie aktywny, w przypadku gdy wcześniej nie wybierzemy żadnego województwa. |
| - | gminy - w przypadku wybrania województw oraz powiatów mamy możliwość wskazania gmin z listy gmin przypisanych do wybranych powiatów. Filtr gmin nie będzie aktywny, w przypadku gdy wcześniej nie wybierzemy żadnego województwa i powiatu. |
Dla jednostek typu CIS i KIS w ramach filtrowania wg pola Wybierz typy jednostek dostępna będzie dodatkowa selekcja umożliwiająca zawężenie wyświetlanych jednostek tylko do tych, które posiadają certyfikat, bądź też do tych, które certyfikatu nie posiadają.
Przy czym nadal będzie możliwe wskazanie w ramach tego pola pozycji Centrum integracji społecznej lub Klub integracji społecznej, co spowoduje zawężenie jednostek wg wyboru bez względu na to czy posiadają certyfikat.
Dodatkowa selekcja będzie dostępna w ramach pola Wybierz typy jednostek tylko wówczas gdy będzie włączona obsługa certyfikacji dla danego typu jednostki.
System RJPS daje również możliwość wyszukiwania jednostek według dodatkowych kryteriów, które znajdują się w oknie "Warunki selekcji". Aby wyszukać jednostkę wg dodatkowych kryteriów, wybieramy ikonę 
. W oknie "Warunki selekcji" mamy możliwość wyszukiwania jednostek wg:
| - | typów jednostek, |
| - | daty rozpoczęcia/zakończenia działalności jednostki, |
| - | kodu pocztowego, |
| - | województwa/powiatu/gminy, |
| - | współrzędnych geograficznych, podając odpowiednią szerokość oraz długość geograficzną, promień, długość i szerokość początku punktu promienia. |
| - | podanych słów kluczowych. |
Po określeniu wszystkich kryteriów wyszukiwania, wybieramy przycisk Zastosuj. System wyświetli na mapie i na liście jednostki wyszukane według podanych kryteriów.
System RJPS daje także możliwość udostępniania rejestru jednostek. Szczegółowy opis sposobu generowania hiperłącza do wyszukiwarki jednostek i sposób jego udostępniania w systemach zewnętrznych znajduje się w rozdziale Udostępnianie listy jednostek.
W ramach wyszukiwania jednostek w systemie RJPS dostępny jest mechanizm pozwalający na wyszukiwanie wolnych miejsc w Domach Pomocy Społecznej (DPS). Szczegółowy opis znajduje się w rozdziale Wyszukiwanie wolnych miejsc w domach pomocy społecznej.
Aby usunąć zdefiniowany filtr wyszukiwania, wybieramy ikonę Wyczyść 
. Wykonanie tej operacji spowoduje wyświetlenie pełnej listy jednostek zarejestrowanych w systemie.